Η ελληνική αποστολή, που θα εκπροσωπήσει τη χώρα στη διοργάνωση του Τόκιο ως τις 5 Σεπτεμβρίου, αποτελείται από 44 αθλητές. Συγκεκριμένα, τα μέλη της ελληνικής αποστολής θα συμμετάσχουν στα εξής αγωνίσματα: Στίβος, Κολύμβηση, Άρση Βαρών σε πάγκο, Μπότσια, Ξιφασκία με Αμαξίδιο, Σκοποβολή, Τοξοβολία, Αντισφαίριση με Αμαξίδιο, Επιτραπέζια Αντισφαίριση, Ποδηλασία και Τζούντο.
Στους Παραολυμπιακούς Αγώνες του Ρίο ντε Τζανέιρο, το 2016, η Ελλάδα είχε κατακτήσει 13 μετάλλια (5 χρυσά, 4 ασημένια, 4 χάλκινα), καταλαμβάνοντας την 24η θέση στον πίνακα μεταλλίων. Ήταν η δεύτερη καλύτερη θέση στην Ιστορία της ελληνικής αποστολής, μετά την 20η στο Πεκίνο.
Την Τετάρτη, 25 Αυγούστου 2021, θα ξεκινήσουν τρία αγωνίσματα στα οποία συμμετέχουν Έλληνες αθλητές. Η κολύμβηση, ξιφασκία με αμαξίδιο και επιτραπέζια αντισφαίριση θα μετάσχουν στην πρεμιέρα των Παραολυμπιακών Αγώνων «Τόκιο 2020».