Τροποποιήσεις στα δρομολόγια των τρένων και πιθανόν καθυστερήσεις στα δρομολόγια στον άξονα Αθήνα-Θεσσαλονίκη θα υπάρξουν έως ότου αποκατασταθούν πλήρως οι ζημιές στην υποδομή λόγω του κυκλώνα "Ιανός".
Πιο συγκεκριμένα, σύμφωνα με ανακοίνωση της ΤΡΑΙΝΟΣΕ ΑΕ, λόγω της κυκλοφορίας των αμαξοστοιχιών από μονή γραμμή στο τμήμα Λιανοκλάδι-Λάρισα, της κυκλοφορίας με diesel αντί ηλεκτράμαξας μεταξύ Λιανοκλαδίου-Παλαιοφαρσάλου και υποχρεωτικής βραδυπορίας σε τμήματα της γραμμής, πιθανόν να προκύπτουν καθυστερήσεις στα δρομολόγια του άξονα Αθήνα-Θεσσαλονίκη.
Σημειώνεται ότι ο Σιδηροδρομικός Σταθμός Παλαιοφαρσάλου θα παραμείνει προσωρινά εκτός εμπορικής λειτουργίας, με αποτέλεσμα τα δρομολόγια Θεσσαλονίκη-Παλαιοφάρσαλος να τερματίζουν στη Λάρισα.
Σε αναστολή κυκλοφορίας παραμένουν τα δρομολόγια στο Παλαιοφάρσαλος-Καλαμπάκα, Αθήνα-Καλαμπάκα, Θεσσαλονίκη-Καλαμπάκα καθώς και τα δρομολόγια στο τμήμα Λιανοκλάδι - Στυλίδα.
Τέλος, τα δρομολόγια των αμαξοστοιχιών 1520 - 21 δεν διέρχονται από το Σιδηροδρομικό Σταθμό Μπράλου, Αμφίκλειας, Λιλαίας (παλαιά γραμμή), μέχρι νεοτέρας.
Σημειώνεται πως, σύμφωνα με τον ΟΣΕ, σταδιακά από την ερχόμενη Δευτέρα 28 Σεπτεμβρίου, θα δοθεί σε διπλή γραμμή το Δομοκός-Λάρισα και έως τις 5 Οκτωβρίου η πλήρης λειτουργία και των δύο σιδηροδρομικών γραμμών.